Tuore suomalaistutkimus valottaa, miten koronaviruksen eri muunnokset kaappaavat käyttöönsä ihmissoluja ja leviävät niiden avulla. Tieto voi auttaa löytämään tehokkaampia hoitoja eri virusvariantteihin. Tulokset julkaistiin Cell Discovery -lehdessä.
Helsingin, Itä-Suomen ja Turun yliopistojen CoVIDD-konsortio selvitti, millä tavoin SARS-CoV-2-viruksen eri variantit, kuten Delta ja Omicron, vuorovaikuttavat ihmissolujen kanssa kaapatakseen niiden toiminnot omaan käyttöönsä. Ymmärrys siitä, miten eri virusvariantit manipuloivat isäntäsolujen toimintoja, voisi mahdollistaa kohdennettujen viruslääkkeiden kehittämisen eri variantteihin. Tällainen tieto on ratkaisevan tärkeää sekä koronaviruksen torjunnassa että tuleviin virusuhkiin valmistautumisessa.
Tutkijatiimi onnistui kartoittamaan kattavasti solureitit, joita eri SARS-CoV-2-variantit hyödyntävät. Eri varianteilla on toisistaan poikkeavat taktiikat, joiden avulla ne pystyvät leviämään elimistössä ja välttämään immuunipuolustuksen.
Tutkimusta johti tutkimusjohtaja Markku Varjosalo ja tutkimusartikkelin ensimmäinen kirjoittaja oli väitöskirjatutkija Sini Huuskonen Helsingin yliopistosta. Itä-Suomen yliopiston farmasian laitoksen professori Antti Poson ja tutkijatohtori Ina Pöhnerin rakentaman tietokoneavusteisen mallin avulla voitiin tunnistaa ja arvioida uusia, mahdollisten koronaviruslääkkeiden kohteiksi sopivia proteiineja ihmissoluissa.
Uusi tieto virusvarianttien eroista ja varianttikohtaisista lääkekohteista on askel kohti täsmähoitoja, joilla voitaisiin estää eri virusvarianttien vuorovaikutuksia isäntäsolun kanssa, vähentää vakavia tautimuotoja sekä hillitä epidemioita. Tulokset antavat lähtökohtia myös uusiin variantteihin varautumiseen.
CoVIDD-konsortio on saanut Suomen Akatemialta rahoitusta koronarokotteiden ja -lääkkeiden tutkimukseen ja lääkekehitykseen. Lisäksi tutkimuksen tärkeänä mahdollistajana oli CSC – Tieteen tietotekniikan keskuksen tarjoama suurteholaskennan ympäristö.
Lisätietoja:
Professori Antti Poso, antti.poso@uef.fi, +358 40 355 2462, Itä-Suomen yliopisto, farmasian laitos
Tutkimusjohtaja Markku Varjosalo, markku.varjosalo@helsinki.fi , +358 2941 59413, Helsingin yliopisto, HiLIFE – Elämäntieteiden instituutti, lääketieteellinen tiedekunta
Väitöskirjatutkija Sini Huuskonen, sini.huuskonen@helsinki.fi, 02941 59414 tai +358 50318 5009, Helsingin yliopisto, HiLIFE – Elämäntieteiden instituutti, Biotekniikan instituutti
Tutkimusartikkeli:
Huuskonen, S., Liu, X., Pöhner, I. et al. The comprehensive SARS-CoV-2 ‘hijackome’ knowledge base. Cell Discov 10, 125 (2024). https://doi.org/10.1038/s41421-024-00748-y