Itä-Suomen yliopisto tarjoaa laajasti erilaisia lääketieteellisiä tutkimuspalveluja rakennebiologisista tutkimuksista lääketutkimuksiin sekä tutkimusaineistoihin. Lääkeainetutkimukset osteoporoosista ja nivelrikosta keskittyvät uusien hoitomuotojen kehittämiseen näille yleisille luu- ja nivelvaivoille, joilla on merkittävä vaikutus potilaiden elämänlaatuun. Bioinformatiikka auttaa analysoimaan ja ymmärtämään biologista dataa, kuten geneettistä informaatiota, mikä on tärkeää uusien lääkkeiden kehittämisessä ja sairauksien ennaltaehkäisyssä. Biopankkinäytteet tarjoavat arvokasta tietoa lääketieteellisessä tutkimuksessa ja diagnostiikassa edistäen räätälöityjä hoitomuotoja ja tautien ymmärrystä.
Yksisolu-genomiikka mahdollistaa ymmärryksen solujen välisistä eroista ja niiden toiminnasta, kun taas rakennebiologiapalvelut tarjoavat tietoa molekyylien kolmiulotteisista rakenteista ymmärtääksemme niiden toimintaa ja vuorovaikutuksia. Virusperäiset geeninsiirrot käyttävät viruksia geenien siirtämiseen soluihin, mikä on keskeinen menetelmä geeniterapiassa ja molekyylibiologiassa. Hyödynnämme tutkimuspalveluissamme muun muassa kantasoluja ja biomateriaaleja sekä nisäkkäiden malliorganismeja, sillä ne ovat tärkeitä tutkimustyökaluja biolääketieteellisessä tutkimuksessa. Translationaaliset teknologiat, kuten lääkesuunnittelu, yhdistävät perustutkimuksen tulokset kliiniseen soveltamiseen, pyrkien kehittämään uusia hoitomuotoja.
Bioinformatiikkakeskuksessa tarjoamme data-analytiikan, menetelmäkehityksen sekä tiedonhallinnan asiantuntijapalveluita. Lisäksi ylläpidämme paikallista laskentapalvelininfrastruktuuria sekä koordinoimme eri alojen tutkijoiden välistä yhteistyötä biolaskentaan liittyvissä kysymyksissä. Bioinformatiikkakeskuksen palvelimet soveltuvat raskaaseen tieteelliseen laskentaan, laajojen tutkimusaineistojen hallintaan ja laskentaympäristöjä voidaan myös räätälöidä tarpeen mukaan eri projektien vaatimukset huomioiden.
Tutustu tarkemmin: Bioinformatiikkakeskus
Ota yhteyttä:
Itä-Suomen biopankki luovuttaa omistamiaan ja hallinnoimiaan näytteitä sekä niihin liittyvää erikoissairaanhoidon kliinistä tietoa korkeatasoiseen terveystieteelliseen tutkimukseen ja tuotekehitykseen luovutuspyynnön perusteella.
Itä-Suomen biopankki tukee esimerkiksi verenkierto-, aineenvaihdunta-, tuki- ja liikuntaelimistön, neurologisten ja syöpäsairauksien sekä mielenterveyden tutkimusta.
Biopankista löytyy useita erilaisia näytetyyppejä, kuten kokoveri, seerumi, plasma, buffy coat, likvori, FFPE-leikkeet ja biopankin näytteistä tuotettu geenidata.
Tutustu tarkemmin: Itä-Suomen biopankki
Ota yhteyttä:
Hanna Kujala, tutkimuskoordinaattori, hanna.kujala@pshyvinvointialue.fi, puh. 044 717 9960
In vivo ja ex vivo elektrofysiologia -keskus tarjoaa laitteistoja ja palveluja solujen ja kudosten toiminnallisiin mittauksiin. Keskus tarjoaa palveluja yksittäisten solujen sähköisten ominaisuuksien mittaamiseen patch clamp -menetelmällä sekä multielektrodiarray (MEA) -mittausmenetelmiä hermoverkkoaktiivisuuden mittaamiseen. Lisäksi keskus tarjoaa palveluja kalsiumkuvantamiselle. Menetelmät soveltuvat soluviljelmille sekä kudosnäytteille.
Tarjoamme myös henkilökohtaista koulutusta, apua ja ohjausta kokeelliseen suunnitteluun, kudosten tai solujen käsittelyyn sekä tietojen analysointiin.
Tutustu tarkemmin: In vitro ja ex vivo elektrofysiologian keskus
Ota yhteyttä:
Kantasolukeskus on A.I. Virtanen -instituutissa toimiva Biokeskus Kuopion palveluyksikkö. Tarjoamme maksupalveluna asiakkaan kudos- tai solunäytteiden uudelleenohjelmointia kantasoluiksi. Menetelmänä on Sendai-virus-pohjainen teknologia ja ohjelmointi tapahtuu niin sanotuilla Yamanaka-faktoreilla (OCT4, SOX2, KLF4 ja C-MYC). Kantasolujen tuoton lisäksi voimme auttaa solujen kasvatuksessa ja erilaistuksessa hermo-, glia- ja sydänsoluiksi.
Tutustu tarkemmin: AIVI kantasolukeskus
Ota yhteyttä:
Palvelumme sisältää kliiniset lääkeainetutkimukset osteoporoosin ja nivelrikon hoitoon. Luun mineraalitiheyden mittausprotokollat voidaan toteuttaa käyttämällä kaksoisröntgenabsorptiometriaa (DXA) tuki- ja liikuntaelinsairauksien tutkimusyksikössä (KMRU). Käytössämme ovat myös toimintakyky- ja lihasvoimamittaukset. Luun muodostuminen, resorptio, mineralisaatio ja mikroarkkitehtuuri voidaan määrittää käyttämällä kvantitatiivista luun histomorfometriaa.
Tutustu tarkemmin: DXA-keskuslaboratoriopalvelut - Tuki- ja liikuntaelinsairauksien tutkimusyksikkö – TULES
Ota yhteyttä:
Heikki Kröger, professori, heikki.kroger@uef.fi, puh. 044 717 2602
Palveluumme kuuluvat kliinis-epidemiologiset tutkimukset ja analytiikka laajoissa väestötutkimuksissa sekä sairauksien riski- ja suojatekijöihin, ilmentyvyyteen ja kustannuksiin liittyvä tutkimus. Lisäksi palveluihimme sisältyvät epidemiologisten tutkimusten suunnitelu, konsultointi, aineistojen hallinta, analysointi ja julkaisutoiminta.
Ota yhteyttä:
Fenotyyppauskeskus tarjoaa tutkimuspalveluja hermoston toiminnan tutkimisessa hiirillä ja rotilla sekä sydänmen ja verenkierron tutkimuksessa hiirillä, rotilla, kaneilla ja sioilla. Tutkimuspalveluihin kuuluvat käyttäytymistutkimukset, sähköfysiologiset mittaukset, histopatologiset määritykset ja in vivo kuvantaminen. Tutkimuksissa voidaan käyttää joko asiakkaan tuottamaa tai jonkin BCK:n ryhmän ylläpitämää tautimallia.
Tutustu tarkemmin: Phenotyping Center (englanninkielinen)
Ota yhteyttä:
Rakennebiologiapalvelu tarjoaa monipuolisia korkean resoluution massaspektrometriapalveluja proteiinianalytiikkaan. Keskeinen osaamisalueemme on natiivimassaspektrometria, jossa proteiinin massa mitataan biologisesti aktiivisessa laskostuneessa muodossa. Tätä teknologiaa voidaan käyttää esimerkiksi proteiini- ja proteiini-ligandikompleksien mittaamiseen. Määritämme myös proteiinien kolmiulotteisia rakenteita röntgendiffraktiolla (proteiinikristallografia).
Tutustu tarkemmin: Bio-orgaaninen kemia
Ota yhteyttä:
Tietokoneavusteinen lääkeainesuunnittelu on kiinteä osa nykyaikaista lääkekehitysprosessia. Ryhmämme hyödyntää näitä menetelmiä niin uusien bioaktiivisten yhdisteiden identifioinnissa kuin myös niiden jatkokehittämisessä. Menetelmiin kuuluvat niin rakennepohjaiset kuin ligandipohjaiset lähestymistavat, kuten telakointi, analogihaut, 3D-QSAR, farmakoforipohjaiset menetelmät, proteiinimallinnus sekä raskas molekyylidynamiikka. Myös potentiaalisten lääkevaikutuskohteiden laadun arvointi on usein käytetty menetelmä erityisesti silloin, kun jonkin uuden projektin aloittamisesta ollaan tekemässä päätöstä. Tämänhetkiset pääkohteet ovat antimikrobiaaliset lääkeaineet, syöpä, silmälääkintä sekä yleisesti menetelmän kehitys.
Ota yhteyttä:
A.I. Virtanen -instituutin virusvektorilaboratorio tuottaa laatuvarmennettuja adeno-, lenti-, bakulo- ja AAV-virusvektoreita laboratorio- sekä laajemmassa mittakaavassa. Virusvektorilaboratoriossa on kaksi GMP-tason ja kolme BSL2/BSL3-tason laboratoriota bioreaktoreineen (10–100 L), inkubaattorit ja laminaarit, vektorien konsentrointilaitteistot, solupankit ja karakterisointiin tarvittavat mittalaitteet.
Virusvektorilaboratorio kuuluu EU:n ESFRI-infrastruktuuriin, ja se on tuottanut kliinisiin faasien I-II eurooppalaisiin monikeskustutkimuksiin GMP-tason vektoreita sekä prekliinisiin tarkoituksiin käytettyjä clinical grade -vektoreita yli sadalle asiakkaalle Suomessa, EU:ssa ja EU:n ulkopuolella viimeisen kymmenen vuoden aikana.
Tutustu tarkemmin: Kansallinen virusvektorilaboratorio
Yhteyshenkilöt
- Johtaja: Seppo Ylä-Herttuala
- Adenovirusvektorit: Johanna Laakkonen
- Lentivirusvektorit: Petri Mäkinen
- AAV-vektorit: Nihay Laham Karam
Ota yhteyttä:
Yksisolu-genomiikan keskus tarjoaa palveluna yksisolusekvenointikirjastojen tekoa (scRNA/ATAC-Seq) sekä konsultaatiota tutkimuksen suunnittelussa ja datan analyysissa. Palvelumme perustuu Chromium- (10x Genomics) sekä Rhapsody- (BD Biosciences) teknologioihin.
Tutustu tarkemmin: Yksisolu-genomiikan keskus
Ota yhteyttä:
